项目名称：云南中医药大学中药学院购置生物样品测序

服务

采购单位：云南中医药大学

项目预算：124776元

采购内容及要求：

一、资格要求

1.投标人须在中华人民共和国境内注册，且具备独立法人资格，提供营业执照（复印件加盖公章）。

2.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。

3.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。

二、采购内容

项目分类

样本数量（例）

真核有参全转录组测序

24

DIA定量蛋白质组

24

非靶代谢组

28

三、检测要求

检测要求

蛋白质组学

检测内容

DIA定量蛋白质组学

检测要求

色谱分离后的样品用Q-Exactive HFX质谱仪（Thermo Scientific）进行DIA质谱分析

检测模式

正检测模式：正离子，一级质谱扫描范围：350-1650 m/z，质谱分辨率：60,000（@m/z 200），AGC target：3e6，Maximum IT：50 ms。MS2采用DIA数据采集模式，设置30个DIA采集窗口，质谱分辨率：30,000（@m/z 200），AGC target：3e6，Maximum IT：auto，MS2 Activation Type：HCD，Normalized collision energy：30，Spectral data type: profile。

数据分析

鉴定与定量结果统计、所有样本PCA分析、组间样本venn分析、差异结果数量统计、火山图分析、聚类分析、亚细胞定位分析、结构域分析、GO功能分析（GO功能注释分类、GO功能富集分析、 topGO有向无环分析）、KEGG通路分析（KEGG通路注释、KEGG通路富集分析、KEGG通路图展示）、互作网络及module分析、表型与组学关联分析、质控分析（色谱峰平均数据点、peak capacity分析、内标iRT保留时间分析、QC样本CV分布、QC样本PCA分布、QC样本相关性、样本定量强度分布、组间样本鉴定数量分布）。

代谢组学

检测内容

非靶代谢组学

检测要求

采用AB Triple TOF 6600 质谱仪进行样本一级、二级谱图的采集。TOF MS scan m/z range：60-1000 Da，product ion scan m/z range：25-1000 Da，TOF MS scan accumulation time 0.20 s/spectra, product ion scan accumulation time 0.05 s/spectra；二级质谱采用information dependent acquisition （IDA）获得，并且采用high sensitivity 模式。

数据分析

实验数据质量分析（QC样本总离子流图的比较、总体样本主成分分析）、代谢物鉴定等级、代谢物鉴定数量统计、代谢物化学分类归属统计、单变量统计分析、多维统计分析（主成分分析、偏最小二乘判别分析、正交偏最小二乘判别分析）、筛选差异代谢物、聚类分析、相关性分析、KEGG通路注释与分析。

数据库

采用本地自建标准品数据库搜库，通过与本地数据库中代谢物的保留时间、分子质量（分子质量误差在<25 ppm内）、二级碎裂谱图、碰撞能等信息进行匹配，对生物样本中的代谢物进行结构鉴定，并对鉴定结果进行严格的人工二次核对、确认。鉴定等级在Level2以上。

转录组学

检测内容

转录组学

检测要求

Illumina测序平台

数据分析

样品间相关性评估、样本间主成分统计图展示、基因表达水平分析、样品基因表达量总体分布、基因差异表达分析、差异基因筛选、差异基因聚类、差异基因GO富集、top GO有向无环图分析、差异基因KEGG富集、KEGG富集散点图、差异基因蛋白互作网络分析、可变剪切事件分类和数量统计、差异可变剪切事件分类和数量统计、新基因挖掘、基因结构优化。

注意：

联合分析要求：联合分析需在同一平台完成，且不允许转包。

四、售后服务

中标人需提供售后服务，数据返回后采购人会进行检测及联合分析服务质量的评估，一旦出现问题，中标人需保证24小时内服务响应，并于48小时以内给予处理办法；上门解答相关问题，讲解结题报告，协助进行思路挖掘；提供项目所有数据。数据保存6个月以上

五、报价材料要求

1.营业执照副本（复印件加盖公章）。

2.法定代表人身份证明书和法定代表人委托书原件（委托代理人投标加盖公章）。

3.报价人公司简介。

4.报价明细表。

5.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。

6.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。

六、报价方式

请具有完成以上服务资质及能力的潜在报价人，将报价材料签字盖章并密封完好，于2021年3月11 日14：00-15:00期间，送至云南中医药大学资产处办公室（因学校处于疫情防控期间，可提前打电话联系后放门卫处），过时将不再接收。联系人：杨老师，联系电话：65918244、13759167276。

七、比价结果确定

采购人将根据报价人报送的报价文件，根据物美价廉的原则择优选定一家报价人为该项目成交人。

附件：报价明细表.xls

云南中医药大学

2021年3月5日